Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam227bQ9D518 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms