Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syf2Q9D198 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syf2Q9D198 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms