Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Upk1aQ9D132 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Upk1aQ9D132 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms