Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm12Q9D0R8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms