Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pin4Q9CWW6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms