Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn1Q9CWM4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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