Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx2Q9CWK8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx2Q9CWK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms