Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Rpl39lQ9CQD0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl39lQ9CQD0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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