Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ubxn6Q99PL6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms