Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tsnaxip1Q99P25 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsnaxip1Q99P25 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms