Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf34Q99KR6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf34Q99KR6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms