Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ophn1Q99J31 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ophn1Q99J31 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms