Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctu1Q99J10 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctu1Q99J10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctu1Q99J10 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctu1Q99J10 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms