Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vps4aQ8VEJ9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms