Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ccdc71Q8VEG0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71Q8VEG0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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