Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Y2

Uncharacterized protein C16orf45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R1Y2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8R1Y2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8R1Y2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8R1Y2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8R1Y2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms