Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim68Q8K243 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim68Q8K243 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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