Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

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Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Slc5a11Q8K0E3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc5a11Q8K0E3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc5a11Q8K0E3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms