Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SbsnQ8CIT9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SbsnQ8CIT9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms