Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms