Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vcpip1Q8CDG3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vcpip1Q8CDG3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms