Protein–RNA interactions for Protein: Q8C428

Tmc7, Transmembrane channel-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc7Q8C428 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmc7Q8C428 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms