Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg16l1Q8C0J2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms