Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Iffo1Q8BXL9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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