Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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