Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp1Q8BJQ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp1Q8BJQ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms