Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup93Q8BJ71 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms