Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gja6Q6S5G4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms