Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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