Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg9bQ6EBV9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms