Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rftn1Q6A0D4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms