Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cln3Q61124 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms