Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Klf3Q60980 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms