Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ripk1Q60855 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ripk1Q60855 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ripk1Q60855 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ripk1Q60855 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ripk1Q60855 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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