Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcf4Q60722 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcf4Q60722 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms