Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgap44Q5SSM3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms