Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf12Q5SPL2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf12Q5SPL2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Phf12Q5SPL2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Phf12Q5SPL2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms