Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Defa23Q5G866 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms