Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SynaQ5G5D5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms