Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag9Q58A65 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spag9Q58A65 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms