Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D130052B06RikQ3UW13 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms