Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssbp4Q3U4B1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms