Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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