Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sppl2bQ3TD49 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms