Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Samd11Q1RNF8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Samd11Q1RNF8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms