Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Atp8b1Q148W0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Atp8b1Q148W0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp8b1Q148W0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Atp8b1Q148W0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b1Q148W0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp8b1Q148W0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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