Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc162pQ0VG85 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms