Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Padi2Q08642 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms