Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sox13Q04891 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms