Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Top1Q04750 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Top1Q04750 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms